盘古古神以无上功法开天辟地，清气上升为天浊气下降为地五行之气凝聚生成宇宙。
混沌初开孕育一五色晶石，日积月累晶石表面被尘土包裹形成一巨石。后来巫族与妖族一役，巫族兵败祖巫共工被逼至不周山下，共工见大势所趋一头撞向不周山，导致神柱倒塌苍天出现一缺口。苍天开裂顿时风起云涌，九天之水倾巢而下，将聚集在不周山下的巫妖二族大部被卷入海底，就连妖帝帝竣也未幸免。后来女娲娘娘寻其巨石开凿数块，以五味真火锻炼成五色神石填补苍天。其实包裹五色晶石的巨石从孕育到形成已经几亿万年，女娲开凿的只是其表面，内部所藏并为显露出来，补天之后女娲娘娘将其移至不周山顶用来镇压被神柱所埋的共工。一次偶然巨石遭九天神雷击中，表皮石层开裂脱落，使五色晶石露出本相。雷击使晶石从晶核上脱落成为五块星屑，晶核受损严重成一顽石，陷入土中。
不周山本是盘古古神脊梁所化灵山，山顶更是灵气充沛，五块星屑得灵气所染，逐渐形成五块拳头大小颜色各异的晶石，并在晶石内产生了一丝懵懂灵识。一日鸿钧老祖闲游至此发现五颗灵晶，用极大法力将灵识从晶石内抽出，并用先天灵气将灵识凝聚送入了轮回，之后老祖将五颗没了灵识的晶石带回混沌洞中，采集先天五行之气锻炼成金、木、水、火、土五颗灵珠。之后老祖将火灵珠传与大弟子人教教主道德天尊（即老子）；金灵珠传于二弟子阐教教主原始天尊；土灵珠（即镇海珠）传于三弟子截教教主灵宝天尊（即通天教主）；将水、木二灵珠分藏一地等待其有缘之人。
不周山一役后巫妖二族相继落寞，人族兴旺发达。鸿钧老祖见妖族所居天宫闲置，便封一直跟随自己修行的昊天童儿为昊天金阙至尊玉皇大帝（简称玉皇大帝或者玉帝），赐予昊天神镜让其接替妖族掌管天宫并统领三界四洲，另令三清适时辅佐。一切事宜之后鸿钧老祖见三界初成，便驾五色祥云遨游三十三外天去了，临走之时在混沌洞外一石碑上留下一偈语“三界难，灵识聚，经轮回，成大道”。
